Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M5A7VMS3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M5A7VMS3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms