Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnf39A2RT81 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rnf39A2RT81 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms