Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl41A2AUC9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl41A2AUC9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms