Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tubb1A2AQ07 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms