Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ttll9A2APC3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms