Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GabreA2AMW3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GabreA2AMW3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GabreA2AMW3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GabreA2AMW3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms