Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Frmpd1A2AKB4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Frmpd1A2AKB4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Frmpd1A2AKB4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms