Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pramel3A2AHA7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramel3A2AHA7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms