Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rhbdl2A2AGA4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhbdl2A2AGA4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms