Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb4A2A863 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Itgb4A2A863 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms