Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pkd2l1A2A259 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l1A2A259 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms