Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc173A0JLY1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc173A0JLY1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms