Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4921501E09RikA0A0R4J054 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4921501E09RikA0A0R4J054 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms