Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5T0

Ighv3-8, Immunoglobulin heavy variable V3-8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-8A0A075B5T0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ighv3-8A0A075B5T0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv3-8A0A075B5T0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ighv3-8A0A075B5T0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ighv3-8A0A075B5T0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Ighv3-8A0A075B5T0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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