Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm37725-201ENSMUST00000193965 2125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Fthl17-ps3-201ENSMUST00000126259 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm2996-201ENSMUST00000211398 537 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm21704-201ENSMUST00000169382 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rbmy-202ENSMUST00000171534 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm21708-202ENSMUST00000188091 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ccdc97Q9DBT3 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms