Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm37531-201ENSMUST00000191628 5415 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm25103-201ENSMUST00000122671 318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm6719-201ENSMUST00000202067 335 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NischQ80TM9 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NischQ80TM9 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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