Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm45156-201ENSMUST00000207255 439 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr480-201ENSMUST00000071658 1029 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Prex2-201ENSMUST00000027056 11053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr39-202ENSMUST00000212983 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Shank3Q4ACU6 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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