Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Eif1-ps3-201ENSMUST00000121450 342 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Cpne9Q1RLL3 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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