Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Agxt2-203ENSMUST00000110541 1222 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Platr25-202ENSMUST00000220733 2859 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Cldn18P56857 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms