Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm3362-201ENSMUST00000148102 466 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm44252-201ENSMUST00000204187 330 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm2398-201ENSMUST00000218347 883 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Wdr20-201ENSMUST00000095410 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm14450-201ENSMUST00000119984 240 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm22562-201ENSMUST00000157334 111 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Magea9-ps-202ENSMUST00000167328 899 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Hoxa10P31310 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms