Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Skint1-204ENSMUST00000162158 1260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r61-201ENSMUST00000166131 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Il18r1-202ENSMUST00000108044 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm26085-201ENSMUST00000157900 116 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms