Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37400-201ENSMUST00000193148 3605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm25906-201ENSMUST00000158489 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms