Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC139579.1-201ENSMUST00000214560 606 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm32526-201ENSMUST00000221878 981 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 5830444B04Rik-204ENSMUST00000166921 2870 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm6100-201ENSMUST00000180253 403 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Mllt11-202ENSMUST00000196025 624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm19116-201ENSMUST00000218592 642 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Speer3W4VSP1 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Speer3W4VSP1 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms