Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC163660.1-201ENSMUST00000223696 818 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 A830008E24Rik-202ENSMUST00000190485 5226 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14893-201ENSMUST00000117904 282 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm9439-201ENSMUST00000119554 973 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm9658-201ENSMUST00000182757 1012 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Minpp1-ps-201ENSMUST00000203344 946 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6070-201ENSMUST00000207275 419 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-202ENSMUST00000098994 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1023-202ENSMUST00000213441 4740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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