Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm18103-201ENSMUST00000216621 779 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Rnft1Q9DCN7 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnft1Q9DCN7 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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