Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1245-201ENSMUST00000214870 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm31218-201ENSMUST00000221181 1498 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg3Q9CPX6 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms