Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm7919-201ENSMUST00000202043 1389 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Clcn3-202ENSMUST00000056508 5684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm40658-202ENSMUST00000221900 701 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr1205-201ENSMUST00000076438 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Ccdc18Q640L5 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms