Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44603-201ENSMUST00000206820 367 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Sh3bp1P55194 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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