Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Uty-204ENSMUST00000139365 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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