Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4933427D14Rik-201ENSMUST00000108505 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr311-203ENSMUST00000216473 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC108401.2-201ENSMUST00000220316 346 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gja6-201ENSMUST00000069417 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm28798-201ENSMUST00000186372 2161 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Hoxd9P28357 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms