Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ptpn9O35239 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ptpn9O35239 Gm19104-201ENSMUST00000198392 679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms