Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Adamts6-203ENSMUST00000224208 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Adcy10-203ENSMUST00000111440 5078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6062-201ENSMUST00000120462 631 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm43788-201ENSMUST00000201539 2417 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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