Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Atg4aQ8C9S8 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Atg4aQ8C9S8 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 AF366264-201ENSMUST00000071308 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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