Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm28395-201ENSMUST00000187794 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm28571-201ENSMUST00000188922 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Tmem182-201ENSMUST00000114765 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm6987-201ENSMUST00000119319 428 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms