Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 AC168062.1-201ENSMUST00000228048 769 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 1700108F19Rik-207ENSMUST00000191384 210 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
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Cntn3Q07409 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Cntn3Q07409 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms