Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28566-201ENSMUST00000186714 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Pkp1P97350 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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