Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm7986-201ENSMUST00000221336 551 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm7712-201ENSMUST00000222214 337 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm10475-201ENSMUST00000084713 1796 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1106-202ENSMUST00000213781 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Peak1-204ENSMUST00000188142 7524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22781-201ENSMUST00000104083 137 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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