Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Slc17a2-201ENSMUST00000006786 4629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm24173-201ENSMUST00000104130 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 E230032D23Rik-201ENSMUST00000207189 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm33308-202ENSMUST00000218566 652 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr770-204ENSMUST00000204712 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr1179-202ENSMUST00000213157 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm8401-201ENSMUST00000120248 1739 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hps1O08983 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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