Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC167222.2-201ENSMUST00000220014 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16568-201ENSMUST00000066038 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13854-201ENSMUST00000121183 1679 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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