Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg3Q9CPX6 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg3Q9CPX6 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg3Q9CPX6 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Atg3Q9CPX6 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms