Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Usp27Q8CEG8 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Ubqlnl-201ENSMUST00000059121 2298 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm12077-201ENSMUST00000117049 364 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Usp27Q8CEG8 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms