Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Foxp2-209ENSMUST00000131414 1381 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Gm28047Q3US59 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Lrrc51-205ENSMUST00000106965 743 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rps12-ps20-201ENSMUST00000121168 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm14507-201ENSMUST00000156169 347 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm5871-201ENSMUST00000176461 718 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm6803-201ENSMUST00000178301 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rps12-ps23-201ENSMUST00000179414 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm2075-201ENSMUST00000180285 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm3321-201ENSMUST00000200603 1129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Tlr4-202ENSMUST00000107365 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm5793-201ENSMUST00000119393 630 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm25989-201ENSMUST00000158761 133 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm20454-201ENSMUST00000172713 221 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms