Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Cpne9Q1RLL3 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms