Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm20713-201ENSMUST00000176344 435 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Lncbate1-201ENSMUST00000211953 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26744-201ENSMUST00000181834 1731 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Cntrl-203ENSMUST00000113032 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Kif24-201ENSMUST00000030148 4333 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm9772-201ENSMUST00000075018 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm6020-201ENSMUST00000092094 66 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nphp3-207ENSMUST00000194774 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Lrrc6-201ENSMUST00000023006 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr1-201ENSMUST00000120303 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rpusd2Q149F1 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpusd2Q149F1 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms