Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44624-201ENSMUST00000208700 2278 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm12643-201ENSMUST00000116078 374 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8317-201ENSMUST00000121261 471 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm27252-201ENSMUST00000183782 689 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm42458-201ENSMUST00000201914 369 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 AC142113.2-201ENSMUST00000217425 748 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm19186-201ENSMUST00000219922 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1043-202ENSMUST00000213886 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC134329.1-201ENSMUST00000217956 1770 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14331-201ENSMUST00000120396 409 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm28080-201ENSMUST00000188552 722 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21524-201ENSMUST00000190499 696 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21715-201ENSMUST00000191056 694 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms