Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 CT009742.1-201ENSMUST00000222507 702 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC134869.2-201ENSMUST00000225788 421 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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VdrP48281 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
VdrP48281 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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