Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1181-202ENSMUST00000102619 1240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr367-ps-202ENSMUST00000143957 942 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 1600029O15Rik-201ENSMUST00000178259 517 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm27208-201ENSMUST00000184323 604 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Hoxc11P31313 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29745-201ENSMUST00000198005 687 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Hoxc11P31313 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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