Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700095A21Rik-201ENSMUST00000145269 1069 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ighv5-19-201ENSMUST00000193466 297 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms