Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm26509-201ENSMUST00000180947 948 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm28985-201ENSMUST00000189261 356 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 AC190403.1-201ENSMUST00000224515 1325 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Olfr619-202ENSMUST00000215732 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Spocd1B1ASB6 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Tenm4-203ENSMUST00000107166 13172 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms