Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm23894-201ENSMUST00000158107 313 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm45844-201ENSMUST00000173842 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm38181-201ENSMUST00000181357 720 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
ChmQ9QXG2 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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